De school valt, met een aantal andere openbare basisscholen in het Centrum, onder het bestuur Openbaar onderwijs aan de Amstel. 

De dagelijkse gang van zaken in de school wordt gedragen door een team van 30 leerkrachten, onderwijsondersteunend personeel en vakleerkrachten. De eindverantwoordelijkheid ligt bij de directie van de school.

De directie,  bestaande  uit een directeur en adjunctdirecteur, vormt samen met de zorgcoördinator, de coördinatoren van de onderbouw (groep 1 tot en met 4) en de bovenbouw (groepen 5 tot en met 8) en de coördinator brede school het managementteam.

Het onderwijs in de school en de groepen, intern en extern overleg,  communicatie onderling, met ouders en externe instanties, de leerlingenzorg, de kwaliteit van het onderwijs, beheer en onderhoud van het gebouw, de activiteiten en nieuwe ontwikkelingen worden door het managementteam bewaakt en aangestuurd.

Door meedenken, meepraten en meewerken van ouders, kinderen, medewerkers en andere bij het onderwijs betrokkenen, wordt het onderwijs en de organisatie op De Kleine Reus verder vormgegeven.